هرچند که 6D برای کاربران DSLR های APS-C که وسوسه ارتقاء به فول فریم را دارند ساخته شده، ولی به هر صورت به عنوان دوربینی فول فریم، لنزهای EF-S که مخصوص APS-C ها ساخته شده اند بر روی این دوربین جوابگو نیستند.